ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИИ, ПРОЖИВАЮЩЕЙ НА ТЕРРИТОРИИ РЕСПУБЛИКИ БАШКОРТОСТАН
https://doi.org/10.15825/1995-1191-2016-1-58-66
Аннотация
Проведено HLA-типирование 1064 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих на территории Республики Башкортостан, по локусам (HLA)-A, -B, -C, -DRB1. В ходе проведенных исследований в изучаемой популяции выявлено два новых аллеля, один из которых зарегистрирован в Комитете по номенклатуре факторов HLA-системы ВОЗ, второй подан на регистрацию. При изучении частоты распределения HLA-аллелей и гаплотипов выявлено 17 аллельных вариантов локуса HLA-A, 29 – HLA-B, 13 – HLA-C, 13 – HLA-DRB1. Частотой встречаемости более 10% обладают следующие аллельные варианты: HLA-A*02 (29,37%), 24 (12,92%), 01 (11,84%), 03 (11,61%), HLA-B*35 (11,51%), 07 (10,76%), HLA-C*07 (22,56%), 06 (15,51%), 04 (13,06%), 03 (10,43%), 12 (10,24%), HLA-DRB1*07 (17,25%), 15 (12,73%), 13 (11,98%), 01 (11,84%), 04 (11,61%). С использованием программного обеспечения Arlequin v.3.1 был выявлен 771 HLA-A-B-C-DRB1 возможный гаплотип. Наиболее часто встречающимися оказались гаплотипы A*02-B*13-C*06-DRB1*07, A*03-B*35-C*07-DRB1*15, A*02-B*07-C*07- DRB1*15 с частотами встречаемости 2,89; 2,18 и 1,93% соответственно. Распределение аллелей и анализ гаплотипов позволили сравнить изученную популяцию с другими российскими популяциями.
Ключевые слова
Об авторах
М. А. Логинова
Отдел донорства гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «Российский медицинский научно-производственный центр «Росплазма» ФМБА России;
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА России
Россия
610002, г. Киров, ул. Ленина, д. 104
Россия
610002, г. Киров, ул. Ленина, д. 104
И. В. Парамонов
ФГБУН «Кировский научно-исследовательский институт гематологии и переливания крови» ФМБА России
Россия
Киров
Россия
Киров
В. Н. Павлов
ГБОУ ВПО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия
Уфа
Россия
Уфа
Г. Ш. Сафуанова
ГБОУ ВПО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия
Уфа
Россия
Уфа
Список литературы
1. Wingard JR, Gastineau DA, Leather HL, Snyder EL, Szcze piorkowski ZM. Hematopoietic Stem Cell Transplantation. A Handbook for Clinicians. 2nd Edition. AABB, Bethesda, Maryland. 2015; 970.
2. Bone Marrow Donor Worldwide (2015). Available at: http://www.bmdw.org/index.php?id=home.
3. Счетчик регистра (2015). Доступен: http://www.rusfond.ru/registr/009#counter (обновление 28.10.2015). The counter register (2015). Available at: http://www.rusfond.ru/registr/009#counter (update 28.10.2015).
4. HARPs Finder (2015). Availbale at: http://www.harps-finder.conexio-genomics.com/index.html.
5. Excoffier L, Laval G, Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics Online. 2005; 1: 47–50.
6. Excoffier L, Slatkin M. Maximum-Likelihood Estimation of Molecular Haplotype Frequencies in a diploid population. Molecular Biology and Evolution. 1995; 12: 921–927.
7. Sequence Alignment Tool. Available at: http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/align.html.
8. Логинова МА, Трофимова НП, Парамонов ИВ. Генетические особенности популяции, проживающей на территории Кировской области. Вестник службы крови России. 2012; 1: 24–28. Loginova MA, Trofimova NP, Paramonov IV. The genetic characteristics of the population living on the territory of the Kirov region. Vestnik sluzhby krovi Rossii. 2012; 1: 24–28.
9. Loginova M, Paramonov I. HLA class I and class II and haplotypes in Tatars, living in the Republic of Tatarstan, Russia. 40th Annual Meeting Abstracts. Tissue Antigens. 2014; 84: 136.
10. Suslova TA, Burmistrova AL, Chernova MS, Khromova EB, Lupar EI, Timofeeva SV et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). International Journal of Immunogenetics. 2012; 39: 394–408.
11. Toropovskiy A, Tyumina O, Trusova L. Estimation of HLA alleles and haplotypes frequencies distribution in population of the Samara Region. 36th Annual Meeting Abstracts. Human Immunology. 2010; 71 (Suppl. 1): S84.
12. EFI standards version 6.2. Available at: http://www.efi-web.eu/efi-committees/standards-committee.html.
Рецензия
Для цитирования:
Логинова М.А., Парамонов И.В., Павлов В.Н., Сафуанова Г.Ш. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИИ, ПРОЖИВАЮЩЕЙ НА ТЕРРИТОРИИ РЕСПУБЛИКИ БАШКОРТОСТАН. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2016;18(1):58-66. https://doi.org/10.15825/1995-1191-2016-1-58-66
For citation:
Loginova M.A., Paramonov I.V., Pavlov V.N., Safuanova G.S. GENETIC CHARACTERISTICS OF THE POPULATION LIVING IN THE TERRITORY OF THE REPUBLIC OF BASHKORTOSTAN. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2016;18(1):58-66. (In Russ.) https://doi.org/10.15825/1995-1191-2016-1-58-66
Просмотров: 1037
Послать статью по эл. почте 